파리 북서부의 노동자 가정에서 태어나서 고등학교 시절부터 청년사회주의 단체에서 활동하였다. 대학에서는 약학과 철학을 공부하였으나 졸업을 하지 않은 채 쟝 우리가 주도하던 보르도 병원에서 일하기 시작하여 그곳에서 의사로서 평생 있었다. 가타리는 1953년에는 라캉이 결성한 파리 프로이트학파에 참여하였다. 그러나 그는 정신분석이 지닌 이데올로기적 기능을 감지하면서 라캉에게 비판적이고 적대적인 입장을 취하게 되었다. 1969년 들뢰즈를 만난 이후 가타리는 프로이트와 마르크스의 분열적 종합을 시도하였으며 사회정치적 무의식에 관한 이론을 구성하기 시작하였다.

전남대학교 사회학과 교수로 오래 전부터 아우토노미아 사상을 한국에 번역ㆍ소개해 오고 있으며 자율운동과 소수자운동, 미시코뮨에 대해 연구해 나가고 있다.
지 은 책으로는『자유의 공간을 찾아서』(2002), 『안토니오 네그리―맑스주의를 넘어선 맑스주의자』(2005), 『우리 시대의 소수자운동』(공저, 2005), 『다르게 사는 사람들』(편저, 2002), 『욕망과 혁명』(2009) 등이 있다. 그리고 네그리, 가타리, 라이히 등의 책을 번역해 왔는데, 가타리의 번역서로는 『분자혁명』(1998), 『기계적 무의식』(2003), 『세 가지 생태학』(2003), 『카오스모제』(2003), 『(가타리가 실천하는) 욕망과 혁명』(2004), 『정신분석과 횡단성』(2004) 등이 있다.